Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CHAMP1Q96JM3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CHAMP1Q96JM3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CHAMP1Q96JM3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CHAMP1Q96JM3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHAMP1Q96JM3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHAMP1Q96JM3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms