Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV0

LRRC46, Leucine-rich repeat-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC46Q96FV0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC46Q96FV0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LRRC46Q96FV0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRRC46Q96FV0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
LRRC46Q96FV0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LRRC46Q96FV0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms