Protein–RNA interactions for Protein: Q96BT1

C3orf49, Putative uncharacterized protein C3orf49, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf49Q96BT1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
C3orf49Q96BT1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
C3orf49Q96BT1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C3orf49Q96BT1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C3orf49Q96BT1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms