Protein–RNA interactions for Protein: Q92791

P3H4, Endoplasmic reticulum protein SC65, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H4Q92791 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
P3H4Q92791 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
P3H4Q92791 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
P3H4Q92791 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
P3H4Q92791 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
P3H4Q92791 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms