Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH6

RAB40A, Ras-related protein Rab-40A, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40AQ8WXH6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RAB40AQ8WXH6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RAB40AQ8WXH6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RAB40AQ8WXH6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RAB40AQ8WXH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms