Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
WDR60Q8WVS4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WDR60Q8WVS4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR60Q8WVS4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR60Q8WVS4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms