Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVF5

KCTD4, BTB/POZ domain-containing protein KCTD4, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD4Q8WVF5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD4Q8WVF5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KCTD4Q8WVF5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KCTD4Q8WVF5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
KCTD4Q8WVF5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KCTD4Q8WVF5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
KCTD4Q8WVF5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCTD4Q8WVF5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCTD4Q8WVF5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms