Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR0

TRAF3IP1, TRAF3-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3IP1Q8TDR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TRAF3IP1Q8TDR0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TRAF3IP1Q8TDR0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TRAF3IP1Q8TDR0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TRAF3IP1Q8TDR0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRAF3IP1Q8TDR0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.5 ms