Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH5

NUP35, Nucleoporin NUP53, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP35Q8NFH5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP35Q8NFH5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NUP35Q8NFH5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
NUP35Q8NFH5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
NUP35Q8NFH5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms