Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ0

DUSP18, Dual specificity protein phosphatase 18, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP18Q8NEJ0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DUSP18Q8NEJ0 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DUSP18Q8NEJ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DUSP18Q8NEJ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DUSP18Q8NEJ0 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP18Q8NEJ0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DUSP18Q8NEJ0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DUSP18Q8NEJ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms