Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
FSIP1Q8NA03 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FSIP1Q8NA03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FSIP1Q8NA03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
FSIP1Q8NA03 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
FSIP1Q8NA03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
FSIP1Q8NA03 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms