Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7P3

CLDN22, Claudin-22, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN22Q8N7P3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CLDN22Q8N7P3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CLDN22Q8N7P3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CLDN22Q8N7P3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN22Q8N7P3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN22Q8N7P3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms