Protein–RNA interactions for Protein: Q8N100

ATOH7, Protein atonal homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATOH7Q8N100 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATOH7Q8N100 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATOH7Q8N100 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATOH7Q8N100 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATOH7Q8N100 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATOH7Q8N100 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ATOH7Q8N100 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ATOH7Q8N100 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms