Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZR5

CMTM4, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4Q8IZR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CMTM4Q8IZR5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CMTM4Q8IZR5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CMTM4Q8IZR5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CMTM4Q8IZR5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms