Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXH7

NELFCD, Negative elongation factor C/D, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFCDQ8IXH7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NELFCDQ8IXH7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NELFCDQ8IXH7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NELFCDQ8IXH7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NELFCDQ8IXH7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NELFCDQ8IXH7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NELFCDQ8IXH7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms