Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDKL3Q8IVW4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDKL3Q8IVW4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDKL3Q8IVW4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CDKL3Q8IVW4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CDKL3Q8IVW4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms