Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
HAPLN4Q86UW8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HAPLN4Q86UW8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HAPLN4Q86UW8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HAPLN4Q86UW8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms