Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5M5

TMC3, Transmembrane channel-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC3Q7Z5M5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMC3Q7Z5M5 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMC3Q7Z5M5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TMC3Q7Z5M5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMC3Q7Z5M5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMC3Q7Z5M5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms