Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z569

BRAP, BRCA1-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAPQ7Z569 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BRAPQ7Z569 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
BRAPQ7Z569 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BRAPQ7Z569 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BRAPQ7Z569 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BRAPQ7Z569 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms