Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SLC46A3Q7Z3Q1 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SLC46A3Q7Z3Q1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC46A3Q7Z3Q1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms