Protein–RNA interactions for Protein: Q6PML9

SLC30A9, Zinc transporter 9, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC30A9Q6PML9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC30A9Q6PML9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC30A9Q6PML9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC30A9Q6PML9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC30A9Q6PML9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC30A9Q6PML9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms