Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD74

AAGAB, Alpha- and gamma-adaptin-binding protein p34, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AAGABQ6PD74 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
AAGABQ6PD74 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AAGABQ6PD74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
AAGABQ6PD74 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AAGABQ6PD74 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AAGABQ6PD74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AAGABQ6PD74 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AAGABQ6PD74 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AAGABQ6PD74 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms