Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRNIPQ6NTE8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MRNIPQ6NTE8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
MRNIPQ6NTE8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MRNIPQ6NTE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MRNIPQ6NTE8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms