Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NANOGP8Q6NSW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NANOGP8Q6NSW7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NANOGP8Q6NSW7 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NANOGP8Q6NSW7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms