Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS38

ALKBH2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH2Q6NS38 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKBH2Q6NS38 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKBH2Q6NS38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKBH2Q6NS38 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ALKBH2Q6NS38 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALKBH2Q6NS38 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALKBH2Q6NS38 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ALKBH2Q6NS38 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.2 ms