Protein–RNA interactions for Protein: Q6EMK4

VASN, Vasorin, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VASNQ6EMK4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VASNQ6EMK4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VASNQ6EMK4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VASNQ6EMK4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VASNQ6EMK4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VASNQ6EMK4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms