Protein–RNA interactions for Protein: Q6AZZ1

TRIM68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, humanhuman

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM68Q6AZZ1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRIM68Q6AZZ1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM68Q6AZZ1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM68Q6AZZ1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM68Q6AZZ1 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM68Q6AZZ1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms