Protein–RNA interactions for Protein: Q68CR1

SEL1L3, Protein sel-1 homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEL1L3Q68CR1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SEL1L3Q68CR1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SEL1L3Q68CR1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SEL1L3Q68CR1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SEL1L3Q68CR1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms