Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ALS2CLQ60I27 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ALS2CLQ60I27 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ALS2CLQ60I27 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ALS2CLQ60I27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ALS2CLQ60I27 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms