Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT99

LRRC38, Leucine-rich repeat-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC38Q5VT99 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
LRRC38Q5VT99 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LRRC38Q5VT99 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
LRRC38Q5VT99 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
LRRC38Q5VT99 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
LRRC38Q5VT99 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms