Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5J6

SWT1, Transcriptional protein SWT1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SWT1Q5T5J6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SWT1Q5T5J6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SWT1Q5T5J6 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SWT1Q5T5J6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SWT1Q5T5J6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SWT1Q5T5J6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms