Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PCID2Q5JVF3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
PCID2Q5JVF3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PCID2Q5JVF3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PCID2Q5JVF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PCID2Q5JVF3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms