Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSP0

FGD3, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD3Q5JSP0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FGD3Q5JSP0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGD3Q5JSP0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGD3Q5JSP0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FGD3Q5JSP0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FGD3Q5JSP0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms