Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AC091489.1-201ENST00000563866 691 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C4orf48Q5BLP8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 HNRNPA1P23-201ENST00000491091 1133 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
C4orf48Q5BLP8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MGA-212ENST00000619521 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 RAB5A-203ENST00000422242 1443 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C4orf48Q5BLP8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms