Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
ANKRD39Q53RE8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ANKRD39Q53RE8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD39Q53RE8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms