Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC9B1Q4ZJI4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SLC9B1Q4ZJI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SLC9B1Q4ZJI4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SLC9B1Q4ZJI4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9B1Q4ZJI4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SLC9B1Q4ZJI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms