Protein–RNA interactions for Protein: Q4VXU2

PABPC1L, Polyadenylate-binding protein 1-like, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1LQ4VXU2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PABPC1LQ4VXU2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PABPC1LQ4VXU2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PABPC1LQ4VXU2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PABPC1LQ4VXU2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PABPC1LQ4VXU2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PABPC1LQ4VXU2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PABPC1LQ4VXU2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PABPC1LQ4VXU2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1LQ4VXU2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1LQ4VXU2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1LQ4VXU2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PABPC1LQ4VXU2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms