Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SPRED3Q2MJR0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SPRED3Q2MJR0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPRED3Q2MJR0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPRED3Q2MJR0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms