Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAQ29983 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MICAQ29983 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MICAQ29983 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MICAQ29983 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MICAQ29983 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MICAQ29983 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MICAQ29983 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MICAQ29983 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
MICAQ29983 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MICAQ29983 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MICAQ29983 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MICAQ29983 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MICAQ29983 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICAQ29983 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICAQ29983 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MICAQ29983 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MICAQ29983 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MICAQ29983 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICAQ29983 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICAQ29983 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICAQ29983 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICAQ29983 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MICAQ29983 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MICAQ29983 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MICAQ29983 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MICAQ29983 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MICAQ29983 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MICAQ29983 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICAQ29983 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICAQ29983 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICAQ29983 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICAQ29983 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MICAQ29983 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MICAQ29983 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MICAQ29983 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MICAQ29983 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MICAQ29983 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MICAQ29983 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MICAQ29983 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICAQ29983 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICAQ29983 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MICAQ29983 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MICAQ29983 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MICAQ29983 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MICAQ29983 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MICAQ29983 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MICAQ29983 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MICAQ29983 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MICAQ29983 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
MICAQ29983 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICAQ29983 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICAQ29983 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICAQ29983 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MICAQ29983 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICAQ29983 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICAQ29983 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICAQ29983 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICAQ29983 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MICAQ29983 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MICAQ29983 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms