Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDK4Q16654 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDK4Q16654 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PDK4Q16654 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDK4Q16654 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDK4Q16654 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
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