Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SGCAQ16586 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SGCAQ16586 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SGCAQ16586 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SGCAQ16586 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SGCAQ16586 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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