Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC38.55■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.54■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC38.54■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.52■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
NCOA1Q15788 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.5■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC38.49■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC38.48■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.45■■■■□ 3.75
NCOA1Q15788 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC38.38■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
NCOA1Q15788 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC38.35■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC38.32■■■■□ 3.73
NCOA1Q15788 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.29■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
NCOA1Q15788 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC38.21■■■■□ 3.71
NCOA1Q15788 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
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