Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TLR1Q15399 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TLR1Q15399 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TLR1Q15399 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TLR1Q15399 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
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