Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 CPNE1-201ENST00000317677 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.211e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-221ENST00000462352 625 ntTSL 213.01□□□□□ -0.331e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 CPNE1-222ENST00000473373 821 ntTSL 212.76□□□□□ -0.371e-8■■■■■ 45.6
PCBP1Q15365 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.271e-23■■■■■ 45.5
PCBP1Q15365 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.561e-23■■■■■ 45.5
PCBP1Q15365 RER1-201ENST00000306256 695 ntTSL 522.77■■□□□ 1.243e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.623e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.063e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 ATP11A-208ENST00000459908 4516 ntTSL 211.33□□□□□ -0.63e-7■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 RER1-205ENST00000443438 540 ntTSL 29.16□□□□□ -0.943e-6■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 ATP11A-204ENST00000418678 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)7.85□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 45.3
PCBP1Q15365 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.786e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.616e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.336e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-214ENST00000491207 469 ntTSL 415.81■□□□□ 0.126e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.056e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-211ENST00000482037 603 ntTSL 514.58□□□□□ -0.086e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-212ENST00000482872 839 ntTSL 514.18□□□□□ -0.146e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-215ENST00000495241 794 ntTSL 212.34□□□□□ -0.436e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.476e-9■■■■■ 45.1
PCBP1Q15365 MAPK1IP1L-202ENST00000553976 517 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.47e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.247e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.967e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.927e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.897e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.647e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.157e-9■■■■■ 44.9
PCBP1Q15365 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.713e-9■■■■■ 44.7
PCBP1Q15365 DOT1L-204ENST00000457590 2907 ntTSL 515.56■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 44.7
PCBP1Q15365 CHKB-205ENST00000468532 1052 ntTSL 534.51■■■■□ 3.121e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 CHKB-204ENST00000465842 428 ntTSL 220.93■□□□□ 0.941e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.673e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 LRP10-202ENST00000470660 486 ntTSL 317.3■□□□□ 0.361e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.153e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-209ENST00000487392 373 ntTSL 515.24■□□□□ 0.033e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.039e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-202ENST00000398761 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.242e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-204ENST00000394890 2844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-201ENST00000263556 2844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.329e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 TBC1D8-201ENST00000376840 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.333e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-212ENST00000642044 2221 ntBASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-211ENST00000635239 2215 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.342e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-203ENST00000436900 1811 ntTSL 512.38□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-215ENST00000604900 1045 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.431e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-205ENST00000449723 2098 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.451e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 KLHDC4-205ENST00000446344 4444 ntBASIC12.17□□□□□ -0.466e-7■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-202ENST00000307116 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 P4HA1-203ENST00000373008 2727 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.529e-9■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-201ENST00000361114 2383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.522e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-214ENST00000552459 3664 ntTSL 210.8□□□□□ -0.681e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 GALNT2-202ENST00000485438 4030 ntTSL 510.69□□□□□ -0.73e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-205ENST00000476605 1933 ntTSL 210.68□□□□□ -0.72e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 NCOR2-214ENST00000453428 674 ntTSL 510.44□□□□□ -0.743e-16■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 MICU1-204ENST00000418483 1212 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.932e-10■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 DAZAP2-202ENST00000425012 1117 ntTSL 2 BASIC8.52□□□□□ -1.051e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.561e-8■■■■■ 44.6
PCBP1Q15365 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.368e-79■■■■■ 44.5
PCBP1Q15365 PXN-208ENST00000538144 1805 ntTSL 1 (best)16.35■□□□□ 0.212e-8■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.042e-8■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.124e-9■■■■■ 44.4
PCBP1Q15365 HIPK3-205ENST00000531504 591 ntTSL 222.12■■□□□ 1.132e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.062e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.222e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TRAF3-201ENST00000347662 7700 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.692e-7■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 AC120057.3-201ENST00000570760 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.42e-12■■■■■ 44.3
PCBP1Q15365 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 319.83■□□□□ 0.775e-13■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-202ENST00000324301 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-209ENST00000579847 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-226ENST00000584581 4523 ntTSL 211.38□□□□□ -0.592e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 CNDP2-208ENST00000579624 1176 ntTSL 58.77□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 44.2
PCBP1Q15365 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.154e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.024e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.264e-13■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-202ENST00000547863 1662 ntTSL 225.83■■□□□ 1.734e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-205ENST00000552176 1485 ntTSL 225.69■■□□□ 1.74e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-204ENST00000607564 892 ntTSL 524.83■■□□□ 1.574e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-203ENST00000549775 1856 ntTSL 523.02■■□□□ 1.284e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-201ENST00000546395 952 ntTSL 1 (best)18.87■□□□□ 0.614e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.564e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-206ENST00000552321 739 ntTSL 218.23■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.514e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.384e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.034e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.034e-10■■■■■ 44.1
PCBP1Q15365 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.245e-7■■■■■ 43.8
PCBP1Q15365 BAZ2A-210ENST00000549787 2773 ntTSL 1 (best)12.65□□□□□ -0.383e-12■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 31e-7■■■■■ 43.7
PCBP1Q15365 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.85■■■□□ 2.851e-7■■■■■ 43.7
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