Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
FRMPD4Q14CM0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
FRMPD4Q14CM0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
FRMPD4Q14CM0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
FRMPD4Q14CM0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
FRMPD4Q14CM0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms