Protein–RNA interactions for Protein: Q14990

ODF1, Outer dense fiber protein 1, humanhuman

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF1Q14990 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ODF1Q14990 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ODF1Q14990 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ODF1Q14990 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ODF1Q14990 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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