Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SMCO1Q147U7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMCO1Q147U7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
SMCO1Q147U7 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SMCO1Q147U7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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