Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MDC1Q14676 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MDC1Q14676 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MDC1Q14676 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MDC1Q14676 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
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