Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM39Q14498 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
RBM39Q14498 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RBM39Q14498 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms