Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LSAMPQ13449 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LSAMPQ13449 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LSAMPQ13449 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LSAMPQ13449 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
LSAMPQ13449 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
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